1.導電性差：目前在實際生產過程中通過在前驅體添加有機碳源和高價金屬離子聯合摻雜的辦法來改善材料的導電性（A123、煙臺卓能正采用這種方法），研究表明，磷酸鐵鋰的電導率提高了7個數量級，使磷酸鐵鋰具備了和鉆酸鋰相近的電導特性。

2.鋰離子擴散速度慢。目前采取的解決方法重要有納米化LiFePO晶粒，從而減少鋰離子在晶粒中的擴散距離，再者就是摻雜改善鋰離子的擴散通道，后一種方法看起來效果并不明顯。納米化已經有較多的研究，但是難以應用到實際的工業生產中，目前只有A123宣稱掌握了LiFePO的納米化產業技術。

3.振實密度較低。般只能達到0.8-1.3，低的振實密度可以說是磷酸鐵鋰的最大缺點。但這一缺點在動力鋰電池方面不會突出。因此，磷酸鐵鋰重要是用來制作動力鋰電池。

4.磷酸鐵鋰離子電池低溫性能差。在0℃時的容量保持率約60~70%，

-10℃時為40~55%，-20℃時為20~40%。這樣的低溫性能顯然不能滿足動力電源的使用要求。當前一些廠家通過改進電解液體系、改進正極配方、改進材料性能和改善電芯結構設計等使磷酸鐵鋰的低溫性能有所提升。

電子導電率低、離子擴散系數低、振實密度不高、合成成本略高